Decidido a retornar a São Paulo, sua terra natal, Dr Alexandre Iscaife ingressou para a Residência Médica em cirurgia geral da Escola Paulista de Medicina/UNIFESP, onde consolidou a formação cirúrgica iniciada na graduação e confirmou dentre todas as áreas cirúrgicas, sua paixão pela Urologia. Após o término dos dois anos de cirurgia geral, ingressou para a Residência Médica em Urologia da Escola Paulista de Medicina. Por três anos mostrou sua dedicação, capacidade e habilidade cirúrgica, recebendo em 2010 o premio Residente Destaque concedido pela Disciplina de Urologia da Escola Paulista de Medicina.